华智生物成功研制“稻芯一号”

长沙晚报网2024-01-20  22

导读:长沙晚报掌上长沙1月18日讯(全媒体记者 伍玲)记者17日获悉,华智生物技术有限公司利用自主研发的cGPS靶向测序分型技术,开发了具有自主知识产权的水稻60K cGPS液相育种芯片“稻芯一号”,将广泛深入地应用于水稻种质资源鉴定、品种真实性…

  长沙晚报掌上长沙1月18日讯(全媒体记者 伍玲)记者17日获悉,华智生物技术有限公司利用自主研发的cGPS靶向测序分型技术,开发了具有自主知识产权的水稻60K cGPS液相育种芯片“稻芯一号”,将广泛深入地应用于水稻种质资源鉴定、品种真实性鉴定、遗传多样性评估等不同应用场景,为培育高产、优质、抗逆、营养高效利用的优异新品种提供高效基因型鉴定技术支撑。

  水稻是全球最重要的粮食作物之一。20世纪40年代至今,中国水稻研究实现了稻种资源收集、矮秆稻品种选育、三系法/两系法杂交水稻培育和超级稻育种等阶段性突破。随着分子生物学、基因组学及生物信息学等学科的飞速发展,水稻育种逐步从传统“经验育种”向“精准设计育种”转变。

  当前,水稻基因组测序完成以后,已开发了大量与生育期、株高、抗病、耐逆、籽粒大小、香味等重要性状相关的分子标记,基于分子标记的高通量、低成本、高密度、高准确性的基因分型技术在分子设计育种中的应用促使水稻育种向高效、精准的方向发展。

  “液相芯片”和传统意义上手机电脑等工业芯片不同,它是生物物种基因检测的重要工具,通过生物芯片可以读取生物样本DNA数据。简单来说,育种芯片可让研究人员了解选育目标的大部分种质特性,从而指导重要品种培育。

  华智生物有关负责人介绍,“稻芯一号”是基于全球89个国家地区的3024份水稻材料的重测序数据,优选代表性强、多态性高、通用性好的SNP位点62027个,涵盖了与水稻产量、稻米品质、生长发育、株叶形态、生物胁迫、非生物胁迫等重要性状相关的基因功能标记和性状/基因连锁标记,以及水稻品种鉴定、水稻品种真实性鉴定、水稻品种籼粳鉴定等多个国家/行业标准位点。位点在染色体上的平均覆盖率为99.8%,位点在染色体上均匀分布。

  经测试验证,“稻芯一号”产品位点检出率高,平均位点检出率为99.56%;产品稳定性好、基因型准确度高,重复样本基因型平均一致率为99.95%;日本晴(稻种名称)平均检出率为99.85%,重复样本基因型一致率为99.99%,与参考基因组基因型一致率为99.70%,产品整体性能优良。


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